En cuanto a las enfermedades que suelen afectarlos, éstas se concentran en las relacionadas con los climas fríos, pues los chihuahuas deben vivir en el interior de la casa. También pueden surgir problemas de tipo cardíacos, pero sin duda hay cuatro enfermedades que sí son recurrentes en estos curiosos perros, los Chihuahua:
- Retención de dientes caducos o de leche: Lo que implica en un momento dado que si no caen por si mismos deben ser retirados por el veterinario.
- Hidrocefalia: Asociada a una enfermedad propia de la raza, por su particular forma craneana, tiene diversos síntomas muchos de ellos graves.
- Luxación de rodilla o luxación patelar: también herencia de la raza y a veces producto de las peleas.
- Problemas de discos intervertebrales: Principalmente en la zona del cuello, lo que le produce dolor y dificultad de desplazamiento.
- Tal como los seres humanos, manifiestan algunas enfermedades fáciles de tratar y otras de complejo diagnóstico cuando son localizadas.